Ban Quản lý chiến lược FPT IS có chức năng và nhiệm vụ: Quản lý việc triển khai chiến lược của FPT IS, điều phối việc thu thập dữ liệu và xử lý các dữ liệu liên quan; Xây dựng bản đồ và thẻ điểm cân bằng tại các trung tâm kinh doanh, công ty thành viên trực thuộc; Chỉ đạo việc xây dựng thẻ điểm, quản lý việc đo các chỉ số đánh giá (KPI) trong thẻ điểm cân bằng và Lập báo cáo định kỳ gửi Chủ tịch và Ban điều hành FPT IS về kết quả triển khai chiến lược.
Ban Quản lý chiến lược do Chủ tịch và Ban TGĐ FPT IS quản lý.