Hai doanh nghiệp đang sử dụng phần mềm của Công ty Hệ thống Thông tin FPT là Vinamilk và VMS Mobiphone cũng được nhận giải thưởng Doanh nghiệp ứng dụng ERP tiêu biểu (Vinamilk) và Doanh nghiệp triển khai ứng dụng phần mềm và công nghệ thông tin tiêu biểu (VMS Mobiphone).
Giải thưởng Sao Khuê được tổ chức thường niên nhằm vinh danh những cá nhân, tổ chức và doanh nghiệp có đóng góp lớn với ngành phần mềm Việt Nam.